离开科技星际小世界后，林羽和艾莉丝来到东方修仙小世界。这里灵气浓郁，奇花异草遍地生长，巍峨的仙山悬浮在空中，云雾缭绕。然而，本该宁静祥和的修仙界却被一层阴霾笼罩，魔修肆虐，各大门派人心惶惶。
两人被传送到苍梧仙宗的山脚下，正巧遇到一群魔修在围攻几位修仙弟子。艾莉丝立刻施展治愈魔法救助伤者，林羽则用混沌之印击退魔修。他们的善举引起了苍梧仙宗长老的注意，被邀请入宗一叙。
在宗门内，林羽和艾莉丝见到了闭关多年的宗主清玄子。“两位小友身怀异宝，却修行驳杂。”清玄子抚须微笑，“若不嫌弃，可在我宗修行一段时间。”林羽拜入剑修一脉，学习以气御剑之术；艾莉丝则跟随丹修长老，研究如何将魔法与灵气融合。
修行过程中，林羽发现混沌之印能吸收天地灵气，转化为独特的混沌真气。他自创了一套“混沌剑诀”，将混沌之力融入剑光，威力惊人。艾莉丝则感悟到，魔法的本质与灵气相通，她将光明魔法与灵气结合，创造出“灵光术”，既能攻击又能治愈。
一日，清玄子将两人唤至密室，展示了一卷古老的玉简。玉简中记载着万游世界的秘辛：上古时期，创世神用“创世火种”创造了万千世界，但火种的力量过于强大，便被分散成七块“混沌碎片”，藏于不通世界。如今，黑暗主宰妄图集齐碎片，重启创世火种，以黑暗重塑宇宙。
“你们身上的混沌之印，或许就是其中一块碎片的共鸣L。”清玄子神色凝重，“魔修们四处抢夺的‘幽冥罗盘’，正是寻找碎片的关键道具。”
此时，魔修大军突然大举进犯苍梧仙宗。为首的是魔修少主夜无殇，他手持幽冥罗盘，周身魔气滔天。“交出混沌碎片，否则仙宗上下鸡犬不留！”夜无殇狂笑，罗盘发出诡异的光芒，控制了不少仙宗弟子。
林羽和艾莉丝挺身而出，与夜无殇展开激战。林羽的混沌剑诀与夜无殇的魔功相撞，爆发出惊天动地的能量波动；艾莉丝则用灵光术净化被控制的弟子，通时寻找罗盘的弱点。
关键时刻，林羽发现幽冥罗盘的核心与混沌之印产生共鸣，他冒险将混沌之力注入罗盘，引发了剧烈的反噬。夜无殇惨叫一声，罗盘破碎，露出里面的一块混沌碎片。林羽顺势将碎片吸收，混沌之印变得更加明亮，他的实力也突破到一个新的境界。
战后，清玄子将记载着上古秘境位置的地图送给两人：“传说中，其他混沌碎片就藏在这些秘境里。前路凶险，望两位小友保重。”
林羽和艾莉丝握紧手中的地图，望向远方。他们知道，随着力量的提升和真相的逐渐揭露，与黑暗主宰的决战已越来越近。而万游世界中，还有更多的秘密和挑战在等待着他们。